More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2202 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2202  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.871962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0918  LysR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4124  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.175412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4033  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  44 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2941  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1268  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00300028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0530  LysR family transcriptional regulator  42 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.979074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0449  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000587967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1206  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2882  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  24.76 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  29.95 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.95 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  24.91 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  23.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0345  transcriptional regulator, LysR family  24.44 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  24.6 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4256  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0437  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3101  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1974  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168317  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0058  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0206813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1887  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3521  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.03 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0247  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2901  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  24.12 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0495  DNA-binding transcriptional activator GcvA  26.15 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0055  transcriptional regulator, LysR family  22.66 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000650557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3143  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>