More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0345 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0345  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0221  transcriptional regulator, LysR family  40.93 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0055  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000650557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  26.43 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  30.48 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  27.04 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  27.94 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  25.87 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  27.13 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  24.21 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0110  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25320  transcriptional regulator  24.92 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  24.82 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1595  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0651841  normal  0.111077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7527  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  24.66 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5370  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.626785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  24.2 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  22.01 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 324 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4611  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.144049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4477  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861356  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  28.68 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>