More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3573 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 281 aa  341  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  61.51 
 
 		 284 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  61.43 
 
 		 284 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  46.91 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2650  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0984  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.95626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4938  transcriptional regulator, LysR family  51.2 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2022  LysR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6616  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2246  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 286 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4176  LysR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.661797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3907  LysR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1099  LysR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421675  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  49.03 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4203  LysR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 284 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3715  transcriptional regulator, LysR family  48.36 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0587379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4369  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1410  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2517  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  42.09 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3176  LysR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4355  transcriptional regulator, LysR family  42.8 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0524  LysR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  40.53 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  39.77 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26470  LysR family transcriptional regulator protein  40.69 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1961  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1157  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  38.28 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0276  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000191888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0872  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1003  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0996  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0813  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.192119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2402  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114186  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2531  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2507  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1871  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2482  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>