More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2337 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  59.86 
 
 		 292 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  57.29 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  56.94 
 
 		 292 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0274  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2517  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3324  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4173  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4193  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831327  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  34.47 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  35.46 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4127  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.65 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  37.7 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  32.54 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  32.54 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.27 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3176  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0524  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>