More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0070 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  96.85 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  96.85 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  94.76 
 
 		 288 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 306 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  94.41 
 
 		 288 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  75.71 
 
 		 293 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  70.11 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  70.46 
 
 		 309 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  70.11 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  70.11 
 
 		 300 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  69.04 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  61.4 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0105  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  43.93 
 
 		 287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  44.61 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  44.61 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  47.39 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5384  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.42 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1058  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2921  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  37.81 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  36.27 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  34.77 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.96 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  32.74 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 291 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4760  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  34.16 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3715  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0587379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>