More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0818 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  59.01 
 
 		 283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  58.66 
 
 		 283 aa  349  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  40.3 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  35.74 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5384  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.28 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629114  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4271  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.79 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  36.9 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2942  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  37.08 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 321 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 348 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  33.82 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  33.09 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>