More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5384 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5384  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 284 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  48.7 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  52.86 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  47.87 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  47.87 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  51 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 309 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  48.33 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 286 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0105  LysR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 284 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1058  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2921  LysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  37.96 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  37.59 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.38 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  35.89 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  36.06 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  35.13 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  38.53 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>