More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0301 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  58.28 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  56.64 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3284  transcriptional regulator, LysR family  56.55 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 289 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.52 
 
 		 291 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4400  LysR family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3885  transcriptional regulator, LysR family  50.98 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2942  LysR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2335  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2949  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2970  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6301  LysR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2656  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 277 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  37.76 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  36.73 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3930  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.983373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.98 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.98 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.98 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.6 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.6 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  36.96 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  36.96 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2512  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  36.26 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  36.26 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0538  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  36.26 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  35.88 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  35.88 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  35.88 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  35.88 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1890  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  35.96 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3690  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.129943  normal  0.235682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>