More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0800 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
298 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1961  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1157  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1003  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0276  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000191888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0872  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
298 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0996  LysR family transcriptional regulator  90.82 
 
 
298 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  77.89 
 
 
298 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2507  LysR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
295 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1871  LysR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
307 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2531  LysR family transcriptional regulator  78.35 
 
 
297 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2482  LysR family transcriptional regulator  76.19 
 
 
307 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2402  LysR family transcriptional regulator  76.87 
 
 
298 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114186  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0813  LysR family transcriptional regulator  75.51 
 
 
303 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.192119  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26470  LysR family transcriptional regulator protein  73.65 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  71.38 
 
 
297 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 
301 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  49.62 
 
 
283 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 
292 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
292 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
292 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
292 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
281 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 
292 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  40.22 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4827  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  41.8 
 
 
284 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0984  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.95626  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  41.26 
 
 
288 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
306 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 
309 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
283 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
298 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
288 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
292 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  41.07 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4176  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.661797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 
280 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 
299 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 
313 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
315 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
298 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
306 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
294 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2517  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0282756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4369  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
282 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
282 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 
291 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
286 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 
292 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
304 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3907  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
289 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  38.76 
 
 
301 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 
302 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 
290 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6616  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
286 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
282 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
290 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
294 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  35.55 
 
 
283 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2246  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 
286 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
321 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
284 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
282 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  34.34 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
321 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
367 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
299 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
322 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
293 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2022  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  33.1 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2650  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>