More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4355 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4355  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  52.54 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  49.05 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0984  LysR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.95626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  44.65 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4938  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  43.96 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2650  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 283 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  42.8 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  40.51 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2022  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2246  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1099  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  41.24 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2517  transcriptional regulator, LysR family  39.27 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4203  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4369  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3907  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4176  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.661797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6616  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3715  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0587379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1410  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3176  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26470  LysR family transcriptional regulator protein  38.38 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2531  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2402  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114186  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0524  LysR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2507  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1871  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2482  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0813  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.192119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  33.46 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  34.36 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0872  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>