More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3808 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3896  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.738753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3808  LysR family substrate binding transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0643  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6116  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  31.49 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.79 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.85 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 		 306 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  30.77 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0344  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4333  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0535  LysR family regulatory protein  33.79 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3197  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0356  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.24 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 289 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3337  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777697  normal  0.289285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  33.77 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  32.98 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0306  LysR family regulatory protein  33.45 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1422  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3026  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  29.21 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 320 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1852  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.387981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.77 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 305 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3620  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3643  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>