More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0287 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  49.65 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 313 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.56 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.58 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 301 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 335 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 298 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  47.4 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  42.18 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  46.53 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1480  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  45.8 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  42.81 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  45.27 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  46.02 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  43.2 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 301 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>