More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2671  LysR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 295 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  55.93 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0461  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 297 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4019  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 295 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4211  transcriptional regulator, LysR family  52.2 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  49.83 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  47.35 
 
 		 301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1990  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 294 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  45.08 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2270  transcriptional regulator, LysR family  47.8 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1245  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6395  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5886  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437235  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5522  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0758082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.39 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0928  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0490463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.86 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1665  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  42.36 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3070  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2115  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.477701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  40.67 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  39.51 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 338 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  38.11 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  37.95 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  37.72 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  37.72 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2275  transcriptional regulator, LysR family protein  37.67 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0234107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 292 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>