More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3332 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 297 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  70.24 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1665  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0928  transcriptional regulator, LysR family  51.93 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0490463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1245  LysR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1990  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2270  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  45.77 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  47.2 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  40.13 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2671  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2115  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.477701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.18 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.94 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0461  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.47 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3070  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273364 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  42.95 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  39.65 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6395  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5522  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0758082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 399 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5886  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437235  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2275  transcriptional regulator, LysR family protein  37.63 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0234107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02101  probable transcriptional regulator, LysR family protein  38.25 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4019  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4211  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 307 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0905  transcriptional regulator, LysR family  40.44 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  41.79 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 555 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>