More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1399 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  50.87 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  50 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  46.67 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1990  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5886  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437235  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5522  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0758082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1665  LysR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 296 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6395  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2270  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2671  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  44.04 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0928  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0490463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.72 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1245  LysR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3070  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2115  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.477701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  44.21 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  43.54 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0461  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.47 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4019  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4211  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.93 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  42.66 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  38.14 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  40.14 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4504  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>