More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2951 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  60.34 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  51.53 
 
 		 301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  47.1 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  44.56 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  43.1 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 306 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 367 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 362 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 353 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 295 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  39.67 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 350 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  40.27 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  42.16 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  42.47 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  40.53 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>