More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0796 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  563  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3091  LysR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0637726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  51.57 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  51.57 
 
 		 319 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 300 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 313 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 295 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  46.58 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  41.11 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3428  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.01 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0905  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>