More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1581 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  87.5 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  87.78 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  75.08 
 
 
313 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  75.08 
 
 
313 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  74.28 
 
 
313 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  74.28 
 
 
313 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  74.6 
 
 
313 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  74.28 
 
 
313 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  73.63 
 
 
313 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  73.14 
 
 
313 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
313 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 
315 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 
315 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 
315 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  65.15 
 
 
315 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  65.05 
 
 
322 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  64.19 
 
 
317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  64.52 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  61.29 
 
 
331 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  61.04 
 
 
331 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  62.66 
 
 
313 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  61.09 
 
 
332 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  63.07 
 
 
315 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  63.4 
 
 
332 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  62.87 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  62.54 
 
 
316 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  59.81 
 
 
315 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  59.49 
 
 
315 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  62.66 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  59.81 
 
 
315 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  58.84 
 
 
315 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
336 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  59.49 
 
 
315 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
336 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
336 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 
315 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
354 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  62.21 
 
 
316 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 
315 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  63.33 
 
 
317 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  62.21 
 
 
316 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
336 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  60.13 
 
 
336 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  56.59 
 
 
323 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  58.5 
 
 
312 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  60.13 
 
 
314 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  60.46 
 
 
314 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 
334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  54.4 
 
 
355 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
322 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
322 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 
322 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
322 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 
322 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  54.4 
 
 
312 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
323 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  54.4 
 
 
318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  52.26 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  54.46 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 
327 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
327 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 
352 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 
315 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
308 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
310 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
310 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
310 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
323 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
324 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.27 
 
 
305 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
320 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  40.07 
 
 
312 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 
335 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>