More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3643 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3643  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 309 aa  607  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1605  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.25782 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  37.38 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3058  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.71 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38.26 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0254  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3584  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3333  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4186  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3620  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  36.49 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3337  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777697  normal  0.289285 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1361  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.260614  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  34.59 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3896  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.738753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0643  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3808  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1457  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.81 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0212  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986643  normal  0.756698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  32.88 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  32.2 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>