More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0363 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  52.03 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  46.82 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.69 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  51.02 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 305 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.4 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0639  transcriptional regulator, LysR family  47.83 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.078735  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.89 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  45.2 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  42.05 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  39.38 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.18 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  37.54 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3168  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6695  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.86 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 334 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 359 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>