More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3058 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3058  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3216  LysR family transcriptional regulator  71.48 
 
 		 306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5905  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.572512  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4850  putative LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 316 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5494  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4540  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799162  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3468  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3164  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674543  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7223  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 304 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2735  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0845  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0188  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3740  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3021  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1392  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0469  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3235  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0632  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0449  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0211  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2808  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1381  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0392  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1392  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2266  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.363264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2881  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2891  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578642  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2935  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2797  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0423  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6222  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4315  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0063  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1757  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73636  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3887  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0600139  normal  0.283003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3643  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  33.44 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.47 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3337  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777697  normal  0.289285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.89 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1915  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0616  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3584  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  33 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3808  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3896  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.738753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0643  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0968  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.564507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3681  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0791735  normal  0.203208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>