More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5494 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5494  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  634    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5905  LysR family transcriptional regulator  82.57 
 
 		 317 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.572512  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3468  transcriptional regulator, LysR family  63.04 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4540  transcriptional regulator, LysR family  63.04 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799162  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0845  transcriptional regulator, MarR family  49.15 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3235  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0632  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0449  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0469  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1381  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2808  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0211  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0392  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3021  transcriptional regulator, LysR family  51.37 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3740  LysR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 312 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7223  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2735  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1392  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 315 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2266  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.363264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2881  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2891  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578642  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1392  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 305 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6222  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4315  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2797  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0423  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 308 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2935  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3058  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.31 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0063  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3216  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1757  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73636  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4850  putative LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3887  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0600139  normal  0.283003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3164  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674543  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0188  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 399 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.09 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4209  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.98 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  32.09 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3085  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3337  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777697  normal  0.289285 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  32.34 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0254  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3643  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  32.3 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>