More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3712 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  67.43 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  63.7 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3853  LysR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 299 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1423  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  51.33 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001225  transcriptional regulator LysR family  50.66 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05092  transcriptional regulator  53.78 
 
 		 245 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  46.53 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.4 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  38.8 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  39.38 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.7 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.27 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1079  LysR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  36.36 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  39.27 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  36.12 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  35.33 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1239  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1066  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>