More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0677 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  90.64 
 
 		 399 aa  544  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  68.94 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 305 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 305 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  61.22 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  55.36 
 
 		 293 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  50.35 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.96 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.77 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  42.16 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  41.95 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  40.62 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  36.3 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  40.07 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  39.79 
 
 		 315 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 555 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1245  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.44 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 333 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  40.83 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3283  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.96132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  40.2 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  37.24 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>