More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4315 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4315  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3740  LysR family transcriptional regulator  84.59 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3021  transcriptional regulator, LysR family  84.25 
 
 		 312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1392  LysR family transcriptional regulator  81.54 
 
 		 305 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2735  transcriptional regulator, LysR family  71.52 
 
 		 302 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1392  LysR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0392  LysR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7223  LysR family transcriptional regulator  67.76 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3235  LysR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0632  LysR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0469  LysR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0449  LysR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0211  LysR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1381  LysR family transcriptional regulator  70.55 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2808  LysR family transcriptional regulator  70.55 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0845  transcriptional regulator, MarR family  67.63 
 
 		 310 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2891  LysR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578642  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2881  LysR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0423  LysR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2266  LysR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.363264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6222  LysR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2797  LysR family transcriptional regulator  69.1 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2935  LysR family transcriptional regulator  68.77 
 
 		 320 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0063  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 301 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3887  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0600139  normal  0.283003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5494  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1757  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73636  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5905  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.572512  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3468  transcriptional regulator, LysR family  47.4 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4540  transcriptional regulator, LysR family  47.4 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799162  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3058  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.7 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3164  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674543  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3216  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4850  putative LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3337  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777697  normal  0.289285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1422  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0188  LysR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3026  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1361  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.260614  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0616  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.62 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4186  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0934  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.18 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.66 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  29.51 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3488  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0588  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0939  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3627  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3620  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3681  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0791735  normal  0.203208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3584  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  31.6 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 288 aa  126  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1658  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0231  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>