More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2226 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  98.46 
 
 
324 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  99.69 
 
 
324 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  99.69 
 
 
324 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  95.08 
 
 
325 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  95.08 
 
 
325 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  96.79 
 
 
324 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  89.75 
 
 
323 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  89.75 
 
 
330 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  89.75 
 
 
330 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  89.44 
 
 
323 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  89.44 
 
 
323 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  90.54 
 
 
321 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  89.44 
 
 
330 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  84.42 
 
 
329 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  83.91 
 
 
336 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  82.97 
 
 
325 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
317 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  46.6 
 
 
317 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  46.94 
 
 
337 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  46.94 
 
 
337 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  46.6 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
311 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
301 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  44.93 
 
 
301 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
301 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  44.93 
 
 
301 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
303 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 
309 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
301 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 
301 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
302 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
307 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.33 
 
 
315 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
300 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  44.14 
 
 
297 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
311 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 
302 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  42.95 
 
 
311 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
301 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
302 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 
302 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 
297 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
305 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1151  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0672  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 
308 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 
304 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
305 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  37.46 
 
 
301 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
300 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
322 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1033  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
305 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
307 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
322 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
300 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
300 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 
298 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
303 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 
302 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1746  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
303 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
297 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
312 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2006  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
315 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0559  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2830  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2878  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2822  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2763  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
305 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1774  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.793189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2451  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
309 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
305 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
303 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  40.82 
 
 
329 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0965  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
314 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292002  normal  0.0128926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 
319 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>