More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1984 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
303 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
303 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5499  transcriptional regulator, LysR family  61.33 
 
 
306 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0853142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 
308 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2390  LysR family transcriptional regulator  60.4 
 
 
323 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5764  LysR family transcriptional regulator  60.93 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710111  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  49.5 
 
 
309 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
301 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
301 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
304 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2450  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
305 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3567  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346329  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2207  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
301 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2354  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
301 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373464  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
304 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 
301 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
302 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
328 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.23 
 
 
307 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.56 
 
 
302 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
303 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.25 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
307 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  37.84 
 
 
293 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
301 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
299 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 
307 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 
307 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
299 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
309 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  35.35 
 
 
297 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
298 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 
293 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
296 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
324 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 
300 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 
300 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
313 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
324 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
298 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
301 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
327 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0678  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
324 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1985  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
330 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1958  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
307 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
301 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
301 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
292 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  34.24 
 
 
299 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
310 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
315 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
307 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
292 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 
306 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0928  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 
291 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0490463  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
307 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
301 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.04 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
299 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
313 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
306 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
311 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
327 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
304 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
299 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
327 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
298 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 
293 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
340 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
300 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1457  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
300 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>