More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6795 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6795  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.775917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 331 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  32.82 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2527  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.12 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  32.64 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.19 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  33.51 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.2 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3224  LysR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000148321  normal  0.133263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 415 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.32 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  30.32 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3568  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.28284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  30.84 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>