More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4926 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  99.05 
 
 		 316 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 		 316 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 316 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 316 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 316 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  91.14 
 
 		 316 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  82.75 
 
 		 331 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  68.05 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  68.79 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  68.27 
 
 		 314 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  64.56 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  60.65 
 
 		 320 aa  363  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  74.55 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  47.45 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  43.81 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  41.52 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2353  galactose-binding protein regulator  72.26 
 
 		 138 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 417 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.53 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>