More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2769 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  93.75 
 
 
304 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
313 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
314 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
314 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
314 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  45.18 
 
 
307 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
318 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  41.06 
 
 
302 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
316 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
316 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
316 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
331 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
321 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
321 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
320 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
351 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
311 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
312 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 
319 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
312 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
308 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 
331 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 
325 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 
314 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
323 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.77 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
320 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 
335 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
315 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
317 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
321 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
320 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  30.74 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
315 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
315 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
317 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
408 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 
319 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
417 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
313 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
313 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 
305 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
339 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
397 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
323 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
306 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
313 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 
334 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
308 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
339 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 
434 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
316 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
313 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
324 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  29.47 
 
 
435 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
318 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  30.43 
 
 
284 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
315 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
308 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
315 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
326 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.95 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>