More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7575 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  90.51 
 
 		 419 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 417 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  71.39 
 
 		 415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  50.25 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.64 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  43.64 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 404 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 328 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 319 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.79 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 316 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 299 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.87 
 
 		 298 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 356 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.1 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 351 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  29.8 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 313 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 314 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 313 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>