More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4443 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
314 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  90 
 
 
314 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
314 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
314 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  89.35 
 
 
314 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  65.9 
 
 
313 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 
307 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  47.7 
 
 
304 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  47.84 
 
 
304 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
318 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 
302 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
321 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 
313 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
331 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
316 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
320 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
313 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
316 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  37.69 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 
314 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
316 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
343 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 
319 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
320 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 
304 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
317 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
312 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
323 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
320 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
323 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
317 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
317 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
321 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
356 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 
319 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 
335 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
339 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 
316 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.59 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  37.62 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
308 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
308 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
313 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
338 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
321 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
338 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30 
 
 
315 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
338 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 
321 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 
322 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
306 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
315 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
318 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
314 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
322 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 
327 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
303 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  33.04 
 
 
299 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>