More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1757 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  47.04 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 314 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  39.81 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.97 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 304 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 417 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 343 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.87 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>