More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 397 aa  786    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  59.75 
 
 		 408 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 415 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  47.97 
 
 		 411 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  47.97 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 417 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  48.23 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 481 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 331 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 299 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 328 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 314 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 302 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 320 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.94 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 300 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.35 
 
 		 302 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.62 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  29.35 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4175  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  normal  0.0617168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3342  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4192  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4418  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3582  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.49 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  30.85 
 
 		 284 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4062  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1120  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00232816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  29.01 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0246  Pca operon transcriptional activator PcaQ  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0982  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0983507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1350  Pca operon transcriptional activator PcaQ  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0139604  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0317  pca operon transcription factor PcaQ  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1844  pca operon transcription factor PcaQ  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.282267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1759  Pca operon transcriptional activator PcaQ  31.85 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0219488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>