More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00118 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  48.61 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  41.9 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  42.25 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 335 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 327 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 335 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  34.7 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 369 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 415 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 419 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>