More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2833 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  57.57 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 315 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  39.93 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 299 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 314 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  35.76 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 304 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1029  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.850278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>