More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3466 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  87.46 
 
 		 335 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  87.66 
 
 		 333 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 314 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.33 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>