More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0494 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  60.26 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  30.53 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5026  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.51 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>