More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0756 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  69.08 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 314 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  30.18 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.21 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  29 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>