More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1032 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  98.14 
 
 		 335 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  87.66 
 
 		 321 aa  564  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 314 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 323 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 312 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.33 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 313 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.96 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>