More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3084 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 351 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.81 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  32.52 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 434 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>