More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4280 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  64.17 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 312 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5026  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.33 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572063  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  30.21 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.45 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4160  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>