More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0040 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  94.94 
 
 		 316 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  94.94 
 
 		 316 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  94.3 
 
 		 316 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  93.67 
 
 		 316 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  93.04 
 
 		 316 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  89.56 
 
 		 316 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 331 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  67.73 
 
 		 316 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  69.77 
 
 		 314 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  69.26 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  65.51 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  73.64 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 320 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  48.09 
 
 		 325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  42.56 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2353  galactose-binding protein regulator  72.26 
 
 		 138 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 335 aa  175  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 327 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  31.64 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>