275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1141 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 316 aa  331  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  73.18 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  73.18 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  72.27 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  74.06 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1056  transcriptional regulator  97.08 
 
 		 335 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  60.36 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  58.64 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2353  galactose-binding protein regulator  97.1 
 
 		 138 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  57.42 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  42.5 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.7 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0847  galactose-binding protein regulator  93.33 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 351 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  30.43 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 397 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.72 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>