More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2394 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 319 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.94 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.64 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 354 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 417 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  28.62 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>