More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5865 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  67.99 
 
 		 307 aa  394  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  48.36 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  48.03 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 351 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1527  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>