More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1464 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 325 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  89.97 
 
 		 341 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  83.08 
 
 		 354 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  77.36 
 
 		 321 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 315 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 417 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  32.67 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  33.21 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  31.15 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 419 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 397 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 426 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2343  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 397 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1220  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  30.92 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>