More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3495 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  99.7 
 
 		 328 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  96.9 
 
 		 323 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  91.64 
 
 		 323 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  91.33 
 
 		 323 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2501  LysR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 322 aa  354  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3342  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4175  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  normal  0.0617168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4192  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4418  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1120  LysR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00232816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0317  pca operon transcription factor PcaQ  30.77 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1759  Pca operon transcriptional activator PcaQ  30.77 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0219488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1844  pca operon transcription factor PcaQ  30.77 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.282267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 335 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4062  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3582  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0982  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0983507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0246  Pca operon transcriptional activator PcaQ  30.45 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1350  Pca operon transcriptional activator PcaQ  30.45 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0139604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>