More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5497 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  49.84 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  48.87 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  31.05 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  31.05 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.78 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  29.94 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  32.04 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.88 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  27.72 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  29.87 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>