More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3031 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4418  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1220  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  28.39 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0434  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.18 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.42 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  29.26 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 426 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.77 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  27.71 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.92 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  29.92 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  30.98 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  30.98 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.98 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>